Apocalypse inaweza kutokea kwa sababu mbalimbali, katika mchezo Apocalypse Run utamsaidia shujaa ambaye alikuwa katikati ya apocalypse ambayo ilionekana kama matokeo ya ghasia za mashine. Akili ya bandia, muonekano wake ambao ulikuwa unasubiriwa sana na kupendezwa na maendeleo yake ya haraka, iliamua kuwa sasa hauitaji watu. Zaidi ya hayo, hata huwa na madhara, kwa sababu hufanya kila kitu kibaya, mara nyingi hutenda kwa ujinga, kuharibu mazingira na kuua aina yao wenyewe. Imani yenye nguvu imeunda akilini mwa mashine kwamba mwanadamu ndiye mwovu mkuu kwenye sayari na lazima aangamizwe. Hivyo ilianza uharibifu wa utaratibu wa wanadamu, na shujaa wa Apocalypse Run anataka kuepuka hili na utamsaidia kupambana na robots.
