Mvulana wa ninja anataka kuthibitisha kwa mwalimu wake kwamba yuko tayari kwa changamoto kubwa na anaweza kukabidhiwa majukumu ya kuwajibika. Katika mchezo wa Ninja Boy Flying, alienda kwa siri kwenye eneo hatari linalokaliwa na majambazi na wahalifu wa kila aina. Shujaa ana nia ya kukimbia kwa kasi, na ambapo ni muhimu kuondokana na vikwazo vingi, atatumia ndege ya kuruka. Maadui watakukimbilia na unaweza kuruka juu yao au kuwaondoa kwa kutupa kwa shuriken - nyota ya chuma iliyo na kingo kali. Una haraka kuguswa na vikwazo na kuamua hata kwa kasi zaidi jinsi ya kuvishinda katika Ninja Boy Flying.
