Katika sehemu ya tatu ya mchezo Sonic Advance 3, utaendelea kusaidia Sonic jasiri na marafiki zake kupigana dhidi ya mwendawazimu Dk. Mwendawazimu anataka kujenga jiji zima ambalo atakua monsters. Ili kufanya hivyo, atahitaji mawe ya Machafuko. Sonic lazima azipate kwanza. Kabla ya wewe kwenye skrini itaonekana kwa tabia yako na rafiki yake. Kwa kutumia funguo za udhibiti, utadhibiti vitendo vya mashujaa wote mara moja. Utahitaji kuwafanya kuzunguka eneo na kukagua kila kitu kwa uangalifu. Tafuta mawe na vitu vilivyotawanyika kila mahali na uvikusanye. Ukiwa njiani utakutana na vizuizi na mitego ambayo mashujaa wako watalazimika kuruka juu. Ikiwa watakutana na monsters, basi wahusika wataweza kuwapita au kuwaangamiza kwa kujiunga na vita. Kwa kuua wapinzani, utapewa alama katika Sonic Advance 3.