Japani ya kale, kulikuwa na mahekalu maalum ambayo waliandaa vita kama vile ninja. Wewe katika mchezo Ninja Run 3d kwenda kwa mmoja wao na kusaidia ninja moja kupitia aina ya mafunzo. Leo, shujaa wako atalazimika kukimbia kwenye kozi maalum ya kizuizi kilichojengwa pamoja na ninjas zingine na aje kwanza kumaliza. Utasimamia vitendo vyake. Lazima kuruka juu ya vikwazo vingi, kupanda vikwazo vingi na kufanya vitendo vingi zaidi ambavyo vitasaidia ninja yako kushinda mashindano.
